亲子鉴定是怎么实现的？

首先，不是所有基因都要测，只测极少部分的标记片段，因为亲子鉴定主要是依据等位基因等信息来确定多个个体间的遗传关系，所以也没必要全测，全测一般人用亲子鉴定的费用也测不起吧目前。一般实践中测的位点会在10几个左右吧，结果如果有3个或超过3个位点不同，则100%排除亲子关系；如果是2个不同或1个不同，则考虑变异可能性，可以加测更多位点。一般排除的准确率应该是100%的，确认的准确率99.9%，不同服务商给出的数据里可能9的个数会不太一样，但大体上是一致的。

其次，现实中确实有部分亲子鉴定的目的是确认小孩到底是自家父亲的，还是叔叔伯伯的这种情况，理论上也是可以分辨出来的。但亲子鉴定的结果并非是确认关系，而是排除关系。

亲子鉴定的基本过程和原理通俗地描述如下吧，希望更加专业的朋友来补充：
1 取样，制备：很多生物医学实验都是这样，包括你去医院化验，都是取样送到医学检验科的；
2 PCR扩增：简单说，就是样品数量非常有限，DNA太少，PCR扩增是复制大量的DNA出来，容易在实验中识别；
3 上机测序跑电泳：即主要是测序仪来完成测序的过程；先要打开DNA双链，加入一些标记，检测结果就主要靠这些标记来识别片段长度等信息；然后跑电泳，粗浅理解为让DNA在电压下“游泳”，因为不同长度的DNA片段游泳的速度不同，那么结果就可分离出不同的长度片段了。 微博上很多做生物实验的人晒图片，也会晒自己的电泳结果图的。
4 软件分析和展示结果： 一般是测3个人的，然后母子父子联合对比结果，孩子的一对等位基因理论上是一个来自母亲一个来自父亲，软件会分析出多少个位点相同或不同。 该结果一般会告诉你是否可排除生物学父亲。如果排除，说明不是亲子；不排除，说明可能是亲子。

当然亲子鉴定的实际场景会比较复杂，最多的主要的是已知母子关系，去检验父子关系。

PS:
一般以上过程中的测序仪，并非全基因组测序仪，这是两个不同时代的产物，也是不同数量级的工作。 当然测序技术突飞猛进，目前是高通量测序仪的天下，而且国外目前已经有便携式的测序仪了，目前1天内就可以测完一个人的全基因组了。